本发明提供了一种污水处理厂污泥中病原微生物的削减方法，其特征在于具体步骤如下：(1)污泥收集；(2)微波预处理，(3)厌氧消化，为了除去微波预处理后污泥中的余留病原微生物，继续进行厌氧消化；将微波预处理后污泥排入厌氧消化池进行厌氧消化；(4)高压CO₂处理；为了除去厌氧消化处理后污泥中的余留病原微生物，继续进行高压CO₂处理；将厌氧消化处理后污泥排入消毒池进行消毒；往消毒池内注入压力为5～10MPa的CO₂气体，同时机械充分搅拌待处理污泥10～20min，经导管输出释放压力，压力降低后CO₂溶解度迅速降低，消毒池内的大量CO₂气体迅速逸散；(5)蚯蚓堆肥。