本发明公开了一种SCWO处理难生化含氮浓有机废水的氧气回收控制系统及方法，通过调节液氧流量，降低汽液分离器上部气体温度至10℃上下；将提纯塔的液位控制在中间，通过减压阀将提纯塔出口液体二氧化碳的压力降低到2MPa；将高压压缩机的流量与汽液分离器的液位进行联锁，将汽液分离器的液位控制在设定范围内；当高压压缩机的流量达到最大时，开启第二缓冲器上的排气阀缓慢排气，排气结束后，继续维持低温液氧泵的流量，完成排气的氧气损失量的补充时，再将液氧流量恢复到正常；利用背压阀将系统运行压力控制在一个误差较小的范围内波动从而维持系统工作压力的相对稳定。