本发明提供了一株寡养单胞菌(Stenotrophomonas sp.)，命名为寡养单胞菌F6，保藏号为CGMCC NO.6547。从寡养单胞菌F6的代谢产物中分离纯化并鉴定了两种溶藻活性物质，分别是环(甘氨酸-脯氨酸)和对苯二酚。环(甘氨酸-脯氨酸)抑制铜绿微囊藻9110的半数有效浓度为9.5mg/L，而对聚球藻BN60无抑制效果；对苯二酚抑制铜绿微囊藻9110和聚球藻BN60的半数有效浓度分别为0.96mg／L和5.6mg／L。寡养单胞菌F6及其溶藻活性物质(环(甘氨酸-脯氨酸)和对苯二酚)可用于新型杀藻剂的开发和生产，最终应用于淡水蓝藻水华的控制。