一种离子交换-零价铁-反硝化菌耦合脱氮方法，以离子交换树脂快速脱除硝酸盐，同时利用零价铁和反硝化细菌完成生物反硝化和离子交换树脂再生的水体硝酸盐进行无害还原，所述离子交换树脂为具有硝酸盐吸附能力的阴离子交换树脂，零价铁为100-300目还原性铁粉，反硝化细菌为厌氧条件下利用氢气进行自养生长的兼性厌氧反硝化细菌。本发明的优点是：将离子交换和铁菌耦合脱氮进行优化组合，不仅使铁菌耦合过程中反应时间短，抑制铵盐等有毒副产物的生成，同时解决了离子交换脱硝不彻底、需要大量碱液再生等问题；反应操作工艺简单，条件容易控制，污染物去除速率快，无二次污染。