本发明提供了一种耦合分子氧活化的高效中性电芬顿氧化水处理方法，它是在pH预调节为5-9的待处理废水体系中，以含单质铁的物质为阳极，多孔碳电极为阴极，多聚磷酸盐为支持电解质，构成电芬顿体系，然后通电，同时向阴极处持续提供空气或氧气，对待处理废水进行电芬顿氧化处理。本发明所使用的电解质多聚磷酸盐不仅能大幅提高废水中有机污染物的去除率、实际废水的COD去除率，同时还能避免由于铁离子水解而产生的大量铁泥，简化了后续处理过程。本发明适用于各种有机废水的处理。