本发明公开了一种生物接触氧化和MBR膜联用技术处理医院污水的系统及污水处理的方法。所述处理医院污水的系统包括依次串联连通的格栅井、厌氧沉淀池、生物接触氧化池、MBR池、消毒接触池；所述格栅井的进水端设有进水管；所述厌氧沉淀池、生物接触氧化池、MBR池上均设有与排泥泵相连的排泥泵进泥管；所述生物接触氧化池、MBR池的底部均设有曝气器单元，该曝气器单元通过管道与鼓风机相连；所述生物接触氧化池内设有组合填料，该组合填料设置在曝气器单元上方；所述MBR池内设有MBR膜组件，该MBR膜组件设置在曝气器单元上方。本发明的整个污水处理站高度装置化设计、占地面积小、无房屋建筑、密闭运行、无噪声、臭气的污染。出水能达到回用水标准，可用于绿化、冲洗厕所和景观等用水单元。