本发明提供了一种污水脱氮除磷深度处理方法，所述方法主要包括预处理、藻类膜生物反应器处理、斜板沉淀池处理和膜滤处理。污水首先进行预处理，然后进入藻类膜生物反应器，对污水进行高效脱氮除磷，随后进入斜板沉淀池，使悬浮物得到沉淀，以防对后续的膜滤造成堵塞，最后污水通过膜组件过滤，滤液储备在透过液水池中以便进行再利用。该方法集生物法、物理法和化学法于一体，具有高效脱氮除磷和去除污水中污染物质，并且整个方法结构简单，管理维护方便，运行成本低廉，无臭气和二次污染的产生，出水水质可以达到国家一级A标准，可以进行回用，提高水资源利用效率。