本发明公开了一种集装箱式污水处理系统，解决集装箱式污水处理设备存在对浓水处理效果差的问题。本发明包括内设有原水增压泵、清洗水箱、阻垢剂装置、高压泵、循环泵、同端进出水分离过滤膜柱、配电柜和控制柜的集装箱外壳；在集装箱外壳后端下部设有进水管道和出水管道，原水增压泵进水端与进水管道连接，其出水端通过第一保安过滤器与高压泵进水端连接，同端进出水分离过滤膜柱进水端通过循环泵与高压泵出水端连接，同端进出水分离过滤膜柱出水端分别与循环泵进水端和出水管道连接；阻垢剂装置连接在第一保安过滤器与高压泵之间，清洗水箱出水端与循环泵进水端连接。本发明可以大幅提高原水的回收利用率。