本发明是有关于一种大型风电机组在微电网系统中的运行控制方法，包括以下步骤：A、采集本调度周期内的实时测风数据；B、根据步骤A所采集的实时测风数据，结合风电机组的实际功率曲线，得到超短期风功率预测值P_{t,avg_wind}，进而确定下一调度周期内的风功率范围；C、根据超短期风功率预测值，结合实时负荷需求、其它分布式电源出力情况以及储能系统的优化控制管理策略，确定下一调度周期内微电网系统能接受的风功率优化值P_{t+1,sys_wind}；本发明大型风电机组在微电网系统中的运行控制方法，无需风场气象数据，无需被动式卸荷负载箱，可集成于微电网能量控制管理系统或上层监控系统，可实施性和经济性较好。