本发明公开一种带锂电池和超级电容的电动汽车的控制系统及其控制方法，其包括三相异步发电机、变频器A和变频器B、超级电容、锂电池和驱动电机，所述超级电容与锂电池并联，锂电池和超级电容一端分别与变频器A连接，变频器A另一端连接三相异步电机，超级电容和锂电池另一端分别与变频器B连接，变频器B另一端连接驱动电机。本发明采用锂电池和超级电容共同作为辅助储能元件，锂电池在夜间用电低峰时，利用充电接口给锂电池充电。当车辆处于轻载和制动时，三相异步发电机再生发电，将动能转化成电能储存于超级电容中，节能减排的效果明显降低。同时，变频器开关电源的输入端连接的恒定电源使变频器能在控制系统允许的所有电压范围内工作。