本发明公开了一种混合储能系统平抑间歇式电源功率波动的控制方法，通过数据采集模块采集间歇式电源实时功率、电源与储能合成出力功率、电池的荷电状态SOC和超级电容器的电压，将数据送至平抑控制模块；在平抑控制模块中对数据进行处理，根据波动功率的大小判断是否需要输出功率；当需要输出功率，则输出控制功率指令和充/放电指令，储能系统按照控制指令出力，储能系统输出的电能经过功率变流器PCS，再与间歇式电源出力分别经过断路器合成，再经过变压器并入电网。本发明克服了现有技术在平抑间歇式电源功率波动时，储能系统大多采用单一储能介质，平抑间歇式电源功率波动能力弱，储能元件使用寿命较短的不足，增强了实用性和经济性。