本发明公开了一种针对大容量储能系统的保护方法。大容量储能系统由多个功率变换器、储能装置及各自升压变压器并联组成，并通过公共耦合点与外电网相连，其保护方法分为公共耦合点处的保护方法与储能单元出口处的保护方法两部分，且均包括过电流保护、交流电压谐波分量检测及带复合电压启动的交流电流检测三个故障诊断环节。本发明能够准确区分区内区外故障，保证故障后损失的储能容量最小，提高了储能系统的利用率与经济效益。