一种光催化降解有机物的分子印迹复合膜及其制备方法，是以光催化剂/海藻酸盐复合膜为载体，待降解有机物为模板分子，以硅烷为功能单体和交联剂，制备对待降解有机物具优先选择性吸附和降解能力的光催化降解分子印迹复合膜。利用催化剂表面的一些亲水基团达到其与海藻酸盐的充分混合，利用光催化剂/海藻酸盐复合膜表面的羟基参与缩聚将分子印迹聚硅氧烷接枝到复合膜上；通过选择光催化剂的种类，改变光催化剂的含量和粒径大小来调节复合膜对有机物的催化降解率；通过选择硅烷的种类，配比和用量来调节分子印迹复合膜对模板分子的吸附量和选择性。该分子印迹复合膜制备工艺简单，成本低，制备过程绿色环保。