本发明属于风力发电变流器相关领域，具体涉及一种兆瓦级风电变流器抗电磁干扰系统，包括发电机转子、变流器、主控制器和变压器，所述变流器分别与主控制器、发电机转子和变压器连接，其特征在于：变流器和主控器之间通过握手通信控制变流器的启停，变流器经过du/dt过电压抑制器和电缆与发电机的转子连接，发电机转子与变压器相连，发电机转子旋转产生的电流通过发电机定子馈送到变压器；本发明的优点在于本设计从系统仿真的思路出发，根据滤波器工作的原理，找到这几种参数对过压能力抑制最本质的影响，从而寻找出最优的参数组合，结合了多种手段改善了电磁干扰对变流器的影响。