一种卫星用电源自主休眠唤醒控制系统，该控制系统包含电路连接的太阳电池阵、分流调节器、功能切换开关、放电调节器、锂离子蓄电池组、放电开关、自主唤醒控制模块和自主休眠控制模块。本发明在卫星能源危机情况下，防止锂离子蓄电池组过放电，保护卫星电源实施自主断电休眠，并在卫星电源恢复至可工作范围时，进行自主唤醒供电，实现了卫星电源在轨自主控制，提高了卫星电源在轨工作的可靠性和安全性。