本发明公开了一种基于视觉传感器的果蝇远程监控系统，包括太阳能供电装置、果蝇诱捕装置和控制监测装置；太阳能供电装置是由太阳能板、支撑架和太阳能蓄电池组成；果蝇诱捕装置包括顶盖、透明的连通件和诱捕瓶，所述顶盖通过连通件与诱捕瓶连接，还包括保护外壳和摄像机，所述连通件安装于保护外壳内，所述摄像机安装于保护外壳的内壁，所述摄像机的摄像头朝向连通件；控制监测装置包括Fit‐pc微型计算机、3G通信模块和通过3G通信模块与Fit‐pc连接的远程服务器，所述Fit‐pc内安装运行一个自主研发的实现自动监测计数的果蝇监测计数软件。本发明还公开了上述监控系统的监控方法以及其中的果蝇监测计数方法。本发明结构简单合理，实时、远程分析处理数据，提高了果蝇监控的智能化程度。