本发明属于医疗仪器技术领域，具体为一种程控多通道电生理刺激器。包括：上位机控制界面、微控制器、脉冲幅度控制电路、桥式放电电路、CPLD、脉冲分发电路。其中，上位机控制界面设置脉冲参数、脉冲发放通道等，把相应的控制指令按照串口通信协议格式发送给微控制器和CPLD；微控制器设置脉冲各项参数，控制相应硬件电路动作，按参数要求产生脉冲；CPLD控制相应通道导通或截止，决定脉冲发放的空间分布区域；脉冲分发电路将桥式放电电路输出的脉冲波通过通道接入对应电极。本发明的脉冲幅度、宽度、间隔、周期、个数、波形、通道数均可灵活调整，可用于心脏起搏式低能量除颤，或者其他需要采用电生理刺激器研究、诊断或治疗的领域。