本发明公开了一种农田灌溉低水位流量监测系统，它由U型渠（1）、农门（2）、输水管(3)、管型控制阀门(4)、控制器(5)、蓄水槽(6)、出水管(7)和流量仪(8）组成，输水管(3)与农门(2)接合，控制器（5）与管型控制阀门（4）相连，管型控制阀门（4）置于输水管（3）与蓄水槽（6）之间，出水管（7）接在蓄水槽（6）底部，流量仪（8）装于出水管（7）末端，控制器（5）、流量仪（8）通过ZigBee无线传输节点（9）、传输基站（11)和上机(12）之间互相传输信号与数据。本发明通过定时蓄水来精确测量流量，实现了基于ZigBee技术的数据无线传输与处理系统，为节水灌溉做出一定的贡献。