本发明公开了一种灌溉系统及应用该灌溉系统浇灌水紫树幼苗的方法，该灌溉系统包括水渠系统、栽培容器和节水灌溉控制系统，其中水渠系统由多条在地表开设的水渠组成，栽培容器安放在水渠上，所述栽培容器的底部设置有通孔，该灌溉系统能实时监测土壤中的含水量，并根据控制单元设定的各项参数值自动向栽培容器中灌水，切实保证植物的正常生长环境。该发明还公开了一种应用该灌溉系统浇灌水紫树幼苗的方法，使用该系统，水紫树幼苗的成长速度和质量都得到了充分的保证。