本发明公开了电力系统优化技术领域中的一种含新能源及海水淡化负荷的海岛微电网优化调度方法。包括：确定第t个时段海岛微电网中风力发电机组输出功率、光伏电池组输出功率和常规负荷功率；确定第t个时段海水淡化负荷功率下限、海水淡化负荷功率上限和蓄电池组的寿命损耗模型；以柴油发电机组燃油损耗最小和蓄电池组的寿命损耗最小为目标，建立优化调度模型；确定海水淡化机组开机数量、蓄电池组充/放电功率和柴油发电机组输出功率。本发明考虑了海水淡化负荷对功率平衡的辅助调剂功能以及蓄电池放电深度对其寿命周期损耗的影响，有效解决含风力发电机组、光伏电池组、柴油发电机组和蓄电池组及海水淡化负荷的海岛微电网优化调度问题。