本发明涉及一种果树专用生物有机肥及其制备方法，其特征在于它以发酵熟化的有机质为基本原料，其质量百分含量为50-65%，在有机质中分别掺入质量百分含量为10-20%的炭粉、5-20%的贝壳粉、1-5%的海藻粉、1-5%的甲壳素，以及0.1-0.2%的海洋侧孢短芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、鞘氨醇单孢菌混合菌粉（三种细菌的质量比为1:1:1，每公斤配料中的有效菌数目为10¹²个以上）。本发明的有机肥组合在保水、营养缓释等方面可以持续供应植物各个时期的生长发育所需，并可以改善土壤理化性状，促进土壤团粒结构的形成。本发明所用大部分材料为水产养殖副产品，能变废为宝，具有明显的环保效应，不会对土壤造成永久性的伤害。