一种遮挡的光伏发电系统输出功率优化方法及系统装置，包括光伏电池板及光伏电池板的电压、电流采集电路及DSP控制器，控制器内置有APSOMPPT最大功率点跟踪控制算法程序，控制器的控制输出端经PWM驱动电路控制一BOOST电路，BOOST电路的输出接负载。跟踪方法是：首先获取光伏电池板的开路电压，根据开路电压确定光伏电池板最大输出电压，系统初始化并启动定时器，当定时时间到时，要运行APSOMPPT最大功率点跟踪控制算法子程序进行多次迭代，最后将迭代过程中的所有粒子的全局最优值作为光伏阵列的电压给定作用于光伏阵列。从而实现光伏发电系统功率优化输出。