本发明属于光伏发电技术领域，并涉及一种光伏扬水逆变器及其控制方法、及光伏扬水系统。该光伏扬水逆变器连接在水泵和光伏阵列之间且具有MPPT功能，本发明的光伏扬水逆变器包含升压电路和逆变电路；升压电路将光伏阵列的输出电压提升至直流母线电压，逆变电路对直流母线电压进行DC/AC转换并输出驱动水泵的交流电压。本发明中，逆变器的升压电路可以在进行DC/AC转换前首先使光伏阵列的直流输出提升，因此使得光伏阵列输出电压的可选范围变宽，进而降低对光伏阵列内各组件的配置要求，使含该光伏逆变器的光伏扬水系统的配置更为灵活。升压和逆变与MPPT功能的组合可实现多种光伏逆变器的控制方式，便于优化对其输出功率和电压转换性能进行有效控制。