本发明公开了一种血清淀粉样蛋白A及其编码基因和应用。血清淀粉样蛋白A基因，核苷酸序列如SEQ？ID？NO.1的第148位-567位碱基所示。血清淀粉样蛋白A，氨基酸序列如SEQ？ID？NO.2所示。该基因在软体动物中属于首次发现，目前该基因除了在脊椎动物中有发现之外，在无脊椎动物中则只有在棘皮动物有所发现。定量PCR实验表明，牡蛎SAA在细菌感染后显著上调，与哺乳动物极为相似，因此该基因也可以作为检测牡蛎健康状况的金标准。通过检测该基因可以随时监测牡蛎的健康状况，对于牡蛎疾病的预防提供一个积极而准确的警戒信号，防止了灾害的扩大。该技术的应用，将进一步提升养殖贝类的种质创新能力，支撑产业的高效可持续性发展。