本发明公开了一种百瓦级高隔离度在线型光隔离器，包括沿正向光入射光轴上依次设置在冷却装置（11）内的第一剥模器（1）、第一光纤准直器（2）、第一光隔离器芯件（3）、2个对称设置的反射镜（5）、第二光隔离器芯件（24）、第二光纤准直器（4）和第二剥模器（17）；第一光纤准直器（2）和第一光隔离器芯件（3）之间设有小光阑A（30），第二光纤准直器（4）和第二光隔离器芯件（24）之间设有小光阑B（31）。本发明具有高隔离度、散热效果好和工作性能稳定的优点，能够用于大功率脉冲激光器。