本发明提供了一种可控皮秒双波长光纤激光器。该可控皮秒双波长光纤激光器利用多个锁模器件共用一个增益光纤实现不同波长的锁模脉冲激光输出，靠偏振的特性实现对皮秒输出的可控，可以通过调制各不同谐振腔内的两个偏振控制器实现激光输出或抑制振荡。