本发明公开了一种阻燃与抗菌性水性聚氨酯涂料的制备方法，在二月桂酸二丁基锡催化剂存在的条件下，将N,N′,N〃-三(2,3-二羟基-5-磺酸基苯甲酰)-1,5,10-三氮杂癸烷与异佛尔酮二异氰酸酯按重量比1:1.2~1:2.5混合，加入增效剂和氯前列烯醇钠，于50~70℃下反应2~3h，得到聚氨酯预聚体A；向预聚体A加入为预聚体A重量1.2~3.2％的扩链剂和预聚体A重量12~25％的溶剂，于65~85℃条件下反应1.5~3.5h，加入预聚体A重量为10~15%的三乙胺进行中和反应30~50min，加水和十二烷基磺酸钠进行乳化，得阻燃与抗菌性聚氨酯涂料。所制备的阻燃与抗菌性聚氨酯环保、价格低廉，广泛应用于墙体、家具、金属器具表面，作为塑料、玻璃、造纸、纺织的粘合剂。