本发明公开了一种改善黄颡鱼鱼苗食性转换期肠道功能的微生态饲料，所述微生态饲料包括如下重量份数的主要功能原料：含菌量为2×10¹⁰个·g^-1的地衣芽孢杆菌0.01～0.02份、金银花全花水提物1～1.5份、果寡糖0.05～0.2份和维生素E0.01～0.03份。该饲料能改善黄颡鱼鱼苗食性转换期肠道功能，饲料配方营养全面、丰富，能促进黄颡鱼鱼苗生长性能、改善黄颡鱼肠道微生态环境，抑制有害菌在肠上皮的定植生长，改善黄颡鱼鱼苗对营养元素的吸收和利用，增强鱼体体质，降低了鱼肠炎发病率，使得鱼类成为无公害绿色环保水产品，为饲料生产者和养殖户提高经济效益，有利于渔业健康可持续发展。