本发明公开了一种罗氏沼虾性别特异的分子标记,在罗氏沼虾基因组中,分离了一段300bp的DNA片段,其序列为SEQ ID NO:23,可用于罗氏沼虾性别的检测。性别特异分子标记的筛选方法,包括:罗氏沼虾DNA的提取,AFLP分析,性别特异片段的克隆,特异性引物的设计,以及性别特异片段可行性的检测等。本发明筛选到了罗氏沼虾雌性特异的分子标记,建立了罗氏沼虾遗传性别鉴定方法,所获得的分子标记可以在罗氏沼虾生长发育早期,外观上不能确定其性别时进行准确、稳定的检测,有利于单性养殖系统的建立,从而提高产量。在罗氏沼虾基因组中获得的此雌性特异片段,为其在染色体上的定位提供了必要条件。