本发明涉及一种氟硅树脂、制备方法及其应用。本发明以有机硅树脂和有机氟树脂为原料，在偶联剂作用下催化缩合生成氟硅树脂；得到的产物可固化成膜，可用作涂层剂，应用于织物后整理可提供拒水效果，同时不损失纺织品服用性能所要求的透湿性能。本发明制备氟硅树脂涂层剂的合成工艺简单，不需要特殊的加工设备，且合成所采用的原材料为工业化原料，适合工业化放大生产。