一种生物技术制备棉秆韧皮纺织工艺纤维的方法，将棉秆依次进行如下步骤的处理：（1）自然法脱胶：脱胶后经清水洗涤，脱水后自然晾干，后打纤；（2）复合生物酶水溶液生物脱胶：将步骤（1）得到的棉秆皮脱胶后经清水洗涤，脱水后自然晾干，得脱胶后粗纤维；（3）去除棉秆韧皮纤维中木质素；（4）脱胶后的漂白及给油处理。本发明是应用生物技术对棉花废弃物棉秆韧皮进行生物脱胶、去除木质素等并制备纺织工艺纤维的工艺技术，复合低碳经济的发展趋势，可拓展到生物质植物韧皮纤维的脱胶及制备，同时从能源制备、造纸材料等方面提出取代木材棉秆综合开发利用的工艺技术方案，产生较大经济效益、良好社会效益。