本发明涉及中医药领域，公开了一种中药组合物及其制备方法和应用。本发明所述中药组合物以重量份计，由8-15份飞机草、1-5份艾叶制成。所述中药组合物可通过乙醇热回流提取、水煎煮提取以及直接粉碎三种方法制备获得。本发明选用外来入侵植物飞机草为原料，并辅以艾叶制备成一种新型的、具有抑菌作用的中药组合物，本发明所述中药组合物不但抑菌效果优于现有产品，而且其原料药来源充足，可以广泛应用到抑菌剂特别是水产养殖抑菌剂的制备中。