本发明公开了一种褐菖鲉鱼苗的培育方法，在光控、温控和水控条件下，通过小球藻液降低水体中有害物，强化水蚤，提高仔鱼和稚鱼的营养，降低仔鱼至稚鱼变态期间死亡率，通过贝壳和马尾藻属藻类，贝壳形成水体底层隐蔽场所，大型悬浮藻类形成水体底层以上至水面的隐蔽空间，可以让稚鱼和幼鱼隐藏，降低稚鱼和幼鱼阶段的互相残食，提高成活率，褐菖鲉鱼苗意成活率可以达到29%左右，通过配合饲料驯化，使褐菖鲉鱼苗适应配合饲料，降低褐菖鲉养殖成本。