一种器件包括半导体衬底和金属氧化物半导体(MOS)晶体管。MOS晶体管包括位于半导体衬底上方的栅电极和位于栅电极旁边的源极/漏极区。源极/漏极接触塞包括下部和位于下部上方的上部，其中源极/漏极接触塞设置在源极/漏极区上方并且与其电连接。栅极接触塞设置在栅电极上方并且与其电连接，其中栅极接触塞的顶面与源极/漏极接触塞的上部的顶面齐平。衬底通孔(TSV)延伸进半导体衬底。TSV的顶面与栅极接触塞和栅电极之间的界面基本上齐平。本发明提供衬底通孔及其形成方法。