本发明属于水产养殖技术领域，涉及虾夷扇贝苗种培育技术，具体涉及一种虾夷扇贝苗种保活运输方法。一种虾夷扇贝苗种保活运输方法，选择无畸形、活力强的苗种，清洗去杂质后装入PE运输袋，根据苗种规格控制承装量PE运输袋注入不要超过容量的2/3的充氧灭菌海水，封紧袋口后放置于2-7℃的低温环境中进行运输，抵达目的地后进行缓冲。本发明工艺简单，包装与运输成本低，便于操作推广，保活运输时间达72小时，成活率高达90%以上，实现了苗种的长途保活运输，有效解决了贝类南移育苗的运输问题，促进新型节能减排贝类育苗产业发展，实现资源的优化配置。