本发明提供了一种鲑鳟鱼三倍体苗种的制备方法。本发明将硬头鳟雌性亲鱼与北极红点鲑雄性亲鱼杂交，7℃条件下，受精卵受精20min后移入26℃水体中热休克20min后，入7℃水体中孵化60天左右，受精卵孵化出仔鱼。孵化期间受精卵发眼率为75％以上，苗种孵化率达到90％以上，得到的仔鱼经流式细胞仪检测，三倍体率为90％-95％。本发明提供的鲑鳟鱼三倍体苗种制备方法，缓解了虹鳟鱼养殖过程中由于长期的近亲繁殖和缺乏系统的选育，导致养殖个体出现了性早熟、个体小型化、病害滋生等问题，同时杂交三倍体具有杂交和三倍体两种优势，在生长速度和抗病能力上明显优于现有的二倍体虹鳟鱼，具有较好的经济效益和市场价值。