本发明涉及船舶防污涂料领域，具体为一种用于为海洋船舶的纳米改性聚硅氧烷无毒低表面能船舶防污涂料及其制备方法，解决船舶外底面的长效无毒防污防腐蚀难题。按重量份数计，聚硅氧烷树脂50-55份；纳米浆1-5份；二甲苯5-8份；丁酯6-10份；乙二醇乙醚醋酸酯2.0-3.0份；分散剂0.3-0.5份；消泡剂0.3-0.5份；流平剂0.1-0.3份；防沉剂0.5-0.8份；气相白碳黑0.4-0.7份；颜料15-22份；填料3-6份；将其按比例配好，分散、研磨至细度30微米以下，配制成甲组分；再将甲组分与乙组分混合固化，制备成无毒长效船舶海洋防污涂料，其是具有极低表面能的表面防护材料，使海生物难以粘附在上面，起到防污防垢作用。