本发明公开了一种克氏原螯虾家系建立的方法，包含以下步骤：1）亲本的选择及培育，2）亲本的配组及培育，3）抱卵虾挑选和孵化，4）幼虾培育，5）供标记虾培育及同塘养殖。本发明方法设计合理，可操作性强，通过对克氏原螯虾家系建立及早期生长比较的研究，为进行大规模家系构建和选育奠定了基础，有助于选育具有生长快速等优良生长性状的新品系，改变现有情况下苗种只能靠从天然水域捕捞或是依靠上一年养殖的留塘虾进行自繁自育和累代繁育的状况，形成系统的克氏原螯虾良种保持和选育技术体系。