本发明公开了一种蛆蛋白饲料的生产方法，包括步骤一、将养殖废弃物和农作物秸秆按照重量份1：2的比例混合均匀，加入占养殖废弃物和农作物秸秆混合物一半重量的发酵完成后的沼液，厌氧发酵，得到蝇蛆培养基质；步骤二、将蝇蛆培养基质堆成条状堆置在网面上，在蝇蛆培养基质上放置蝇卵，然后在蝇卵上覆盖一层蝇蛆培养基质，控制环境温度20至25℃育蛆；步骤三、收集蛆，得到蛆蛋白饲料；育蛆结束后，将网面上的蝇蛆培养基质收集，作为农业生产用有机肥。本发明中，将养殖废弃物和农作物秸秆进行混合，并通过沼液进行发酵，既充分利用了这些本可能造成环境污染的杂物，又达到降低成本的目的，具有较佳的经济效益和环境效益。