本发明涉及血清牛磺鹅去氧胆酸和鹅去氧胆酸作为诊断标记物在制备诊断新生儿胆道闭锁的医疗器械中的应用，所述的医疗器械的诊断标记物为血清中牛磺鹅去氧胆酸和鹅去氧胆酸的含量比值。本发明还提供鹅去氧胆酸的应用。本发明优点在于：首次提出牛磺鹅去氧胆酸和鹅去氧胆酸作为胆道闭锁诊断标记物的应用，可用于区分胆道闭锁和其它婴儿胆汁淤积疾病，为患儿争取最佳手术时间，提高手术疗效。