本发明属于药物合成技术领域，提供了一种合成7-二氟甲氧基-5，4′-二正辛烷氧基异黄酮的方法，以金雀异黄素为原料，经过二氟甲醚化、正辛烷氧基化等化学结构修饰得到新型金雀异黄素类似物7-二氟甲氧基-5，4′-二正辛烷氧基异黄酮，通过波谱特征对7-二氟甲氧基-5，4′-二正辛烷氧基异黄酮进行了结构确证，同时该方法所制备出的7-二氟甲氧基-5，4′-二正辛烷氧基异黄酮具有靶向根除肿瘤干细胞的作用。