本发明提供了用于皮肤愈合和毛囊再生的药物组合物及其制备方法和用途，其中，该药物组合物包括：自组装多肽水凝胶，所述自组装多肽水凝胶是由RADA16-I和PRG的至少一种形成的；以及皮肤细胞，所述皮肤细胞设置于所述自组装多肽水凝胶内部。发明人发现，利用本发明的该药物组合物，能够有效促进皮肤愈合和毛囊再生。另外，本发明的药物组合物中的自组装多肽水凝胶全人工合成，不传播动物源性疾病，具有良好的组织特异性，有利于组织特异性干细胞分化微环境的构建，且材料来源更加稳定，质量标准易于控制。