本发明公开了一种软骨组织工程修复支架及其制备方法，属于软骨组织修复领域。该支架包括天然高分子水凝胶和表面偶联有骨髓间充质干细胞亲和肽的脱钙骨基质，通过将骨髓间充质干细胞亲和肽偶联到脱钙骨基质表面，得到具有特异性骨髓间充质干细胞亲和能力的软骨组织工程修复支架。将其置于软骨缺损区能够募集到大量BMSC，且在该支架中天然高分子水凝胶与脱钙骨基质的配合作用下，BMSC能够长期保留在软骨缺损区，保证了软骨修复具有更长的疗效期。本发明还公开了该支架的制备方法，通过将天然高分子水凝胶溶液注射至表面偶联有骨髓间充质干细胞亲和肽的脱钙骨基质中进行凝胶化反应，得到力学强度及诱导能力均较高的支架。该方法简单，实用性高。