本发明公开了一种壳金长牡蛎新品系的选育方法，其特征在于：操作步骤为：（1）第一代选育：选择左壳为金色的野生长牡蛎亲贝，建立多个无亲缘关系的家系。（2）第二代选育：从建立的第一代家系中选出壳金性状明显的家系中筛选出左右壳均为金色的长牡蛎进行家系内自交。（3）第三代选育：从建立的第二代家系中获得的左右壳均为金色性状的家系进行家系间杂交。（4）第四代选育：对左右壳均为金性状进行稳定性验证。本发明加速了长牡蛎壳色新品系的选育进程，增加了养殖贝类新品种。通过颜色性状提高了产品的附加值，通过生长性状提高了养殖产量，增加了养殖企业和养殖户的收入，市场前景广阔。