本发明属于促进间充质干细胞成骨分化技术领域，公开了一种磁性纳米材料在促进间充质干细胞成骨分化中的应用。其中磁性纳米材料为活性成分，其具有促进间充质干细胞分化成成骨细胞的作用。毒性检测证明本发明的三氧化二铁纳米修饰的纳米钌和三氧化二铁纳米修饰的纳米硒磁性纳米材料对间充质干细胞几乎无毒性。茜素红和油红O染色证明本发明制备的磁性纳米材料具有促进间充质干细胞成骨分化，抑制成脂分化的作用。本发明制备的磁性纳米材料，如三氧化二铁纳米修饰的纳米钌或纳米硒，直接以过量的纳米钌或纳米硒与三氧化二铁纳米耦合，制备过程无需添加其它辅助试剂、产物体系简单，产品可直接保存和使用。