本发明涉及生物技术领域，特别涉及一种刺激体内内源干细胞的组合物及其应用。刺激体内内源干细胞的组合物，基底液中含有粒细胞集落刺激因、血小板源生长因子、转化生长因子-β、人胰岛素样生长因子、重组人表皮生长因子、血管内皮生长因子，基底液是由数量级10⁵个/ml浓度的人脐带间充质干细胞悬液与质量浓度为3％-5％的壳聚糖水溶液按体积比为1-2:3-4混合得到的混合液。该组合物各组分协同增强作用，促进干细胞的激活与增殖，并迁移至靶区进一步分化与整合，营养全身，作用持久。本发明还提供了该组合物在制备治疗肿瘤、颈肩部疾病、腰腿痛、心脏类疾病、糖尿病以及神经系统疾病中的药物的应用，效果显著。