本发明涉及一种人工湿地系统及其应用，该系统包括湿地主体、隔墙、进水管、出水管、布集水管及可调出水堰，隔墙设有两个，两个隔墙布设在湿地主体的内部，并将湿地主体从上到下分为上侧好氧区、厌缺氧区及下侧好氧区，上侧好氧区与下侧好氧区的一侧均同时设有进水管与出水管，布集水管设在上侧好氧区与下侧好氧区的两侧，其中未设有进水管或出水管一侧的布集水管贯通连入厌缺氧区，可调出水堰设在上侧好氧区与下侧好氧区设有进水管或出水管一侧的布集水管的内侧。与现有技术相比，本发明具有工艺简单、运行费用低、不易堵塞，脱氮除磷效果好、可通过PLC等实现自动控制、可以适用于不同水量的处理规模、可操作性强等优点。