本发明公开了一种标记干细胞的方法及对应的磁力引导装置。利用超顺磁氧化铁纳米颗粒的铁磁性，采用磁力引导靶向技术使目标干细胞在靶组织定向富集，具有安全有效，方法简便等优点，随着干细胞治疗方法的推广，具有广泛的应用前景；同时，磁力引导设备为内径呈梯度变化的U形磁铁组成，在使用中，随着血液流动，磁力强度呈梯度变化，从而可以有效缓解甚至避免由于磁力过大引起的细胞堵塞问题，相对比无变化磁场引导等方法，进一步提高安全性。