本发明公开了使用单倍体干细胞高效建立遗传修饰动物模型的方法。具体地，本发明公开了使用单倍体干细胞高效建立遗传修饰动物模型的方法，其包括：a)使用同源重组敲除孤雄单倍体胚胎干细胞的H19基因；b)筛选和鉴定正确敲除H19基因的孤雄单倍体胚胎干细胞；c)将所述正确敲除H19基因的孤雄单倍体胚胎干细胞注射到卵母细胞胞质中，以产生半克隆的遗传修饰动物。本发明的方法通过建立敲除H19基因的孤雄单倍体胚胎干细胞系来模拟精子的功能以高效地生成可育的后代，继而可用于开展新的遗传操作并建立相应的基因修饰动物模型。