一种用于在治疗前预测癌症患者是否有可能或不可能从施用基于酵母的免疫应答生成型治疗中受益的方法和系统，所述治疗可以是单独或联合另一种抗癌治疗的针对基于突变Ras癌症的基于酵母的免疫治疗。本方法使用血液来源的患者样品的质谱和配置为分类器的计算机，所述分类器使用来自从单独或联合另一种抗癌治疗的免疫应答生成型治疗中受益或未受益的其他癌症患者的分类标签谱的训练集。还公开了治疗癌症患者的方法，包括对根据本文公开的预测性质谱方法测出的患者施用基于酵母的免疫应答生成型治疗(其可以是针对基于突变Ras癌症的基于酵母的免疫治疗)，其中所述谱的分类标签表明该患者很有可能从该基于酵母的免疫治疗中受益。